Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp3Q3ULW8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms