Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gpr55Q3UJF0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gpr55Q3UJF0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms