Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms