Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Puf60Q3UEB3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms