Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp8Q3UD82 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp8Q3UD82 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp8Q3UD82 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp8Q3UD82 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp8Q3UD82 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp8Q3UD82 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp8Q3UD82 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp8Q3UD82 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp8Q3UD82 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp8Q3UD82 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp8Q3UD82 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp8Q3UD82 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp8Q3UD82 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms