Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U7U4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U7U4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U7U4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3U7U4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3U7U4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms