Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YrdcQ3U5F4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms