Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TraddQ3U0V2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TraddQ3U0V2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms