Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trappc9Q3U0M1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc9Q3U0M1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc9Q3U0M1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms