Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pip4p1Q3TWL2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pip4p1Q3TWL2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms