Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Smarca4Q3TKT4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Smarca4Q3TKT4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms