Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp39Q3TIX9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms