Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hddc2Q3SXD3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms