Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms