Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M3Q31093 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms