Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim71Q1PSW8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trim71Q1PSW8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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