Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrriq3Q14DL3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrriq3Q14DL3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms