Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam171bQ14CH0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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