Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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