Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps8Q0P5W1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms