Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kndc1Q0KK55 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kndc1Q0KK55 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms