Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ttc21bQ0HA38 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttc21bQ0HA38 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms