Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox4Q06831 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms