Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp2Q06649 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp2Q06649 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp2Q06649 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms