Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx2Q06348 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms