Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cab39Q06138 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cab39Q06138 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms