Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms