Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoc2Q05020 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc2Q05020 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms