Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sox13Q04891 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms