Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox10Q04888 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms