Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr5Q04683 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms