Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms