Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx2Q03358 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msx2Q03358 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms