Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms