Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NfiaQ02780 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms