Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snai1Q02085 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms