Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col1a2Q01149 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a2Q01149 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms