Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde4dQ01063 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4dQ01063 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms