Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Serpina1cQ00896 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms