Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col8a1Q00780 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col8a1Q00780 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col8a1Q00780 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col8a1Q00780 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col8a1Q00780 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col8a1Q00780 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col8a1Q00780 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col8a1Q00780 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col8a1Q00780 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col8a1Q00780 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col8a1Q00780 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col8a1Q00780 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col8a1Q00780 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col8a1Q00780 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col8a1Q00780 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col8a1Q00780 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col8a1Q00780 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col8a1Q00780 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col8a1Q00780 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms