Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfaQ00731 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms