Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GabpaQ00422 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GabpaQ00422 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms