Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms