Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb4P99026 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms