Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1bP97952 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms