Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cited1P97769 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cited1P97769 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cited1P97769 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cited1P97769 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cited1P97769 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cited1P97769 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cited1P97769 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cited1P97769 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cited1P97769 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cited1P97769 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cited1P97769 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cited1P97769 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cited1P97769 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cited1P97769 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cited1P97769 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cited1P97769 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cited1P97769 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cited1P97769 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cited1P97769 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms