Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms