Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas1P97459 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas1P97459 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas1P97459 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas1P97459 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas1P97459 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas1P97459 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas1P97459 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas1P97459 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas1P97459 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas1P97459 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms