Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx2P80206 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx2P80206 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx2P80206 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx2P80206 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx2P80206 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otx2P80206 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms