Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CiitaP79621 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CiitaP79621 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiitaP79621 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiitaP79621 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiitaP79621 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CiitaP79621 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CiitaP79621 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CiitaP79621 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CiitaP79621 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CiitaP79621 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CiitaP79621 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CiitaP79621 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CiitaP79621 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CiitaP79621 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CiitaP79621 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CiitaP79621 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CiitaP79621 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CiitaP79621 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CiitaP79621 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CiitaP79621 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CiitaP79621 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CiitaP79621 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CiitaP79621 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms